由于宫角妊娠手术有很多种，根据不同种类的手术，其手术最佳时间也是不同的。如果人们选择药物流产、人工流产手术的话，进行手术的最佳时间是50天之内，超过50天的话药物流产使用的药物对胚胎已经无效，做手术会出现效果不良的情况，超过50天做人工流产对孕妇也会有很大的危险。
而清宫手术、腹腔手术进行的时间不一定，但是在胚胎尽可能小的时候进行手术比较好，但是为了手术顺利，最好等到胚胎一个月左右进行手术。总的来说宫角妊娠手术进行的最佳时间在30-50天左右，怀孕的时间越长，进行手术的难度就越大，而且子宫增大后，进行手术到时子宫穿孔的几率也就更大。
