1、异位种植学说：女性的经血当中含有子宫内膜组织，当发生经血逆流时，可将子宫内膜带至身体其他部位，如卵巢、盆腔等；先天性阴道闭锁、宫颈狭窄等可阻碍经血排出，从而易导致经血逆流；剖宫产、人工流产、输卵管通液等多次宫腔手术操作易将子宫内膜带至其他部位直接种植。另外，子宫内膜也可通过淋巴及静脉系统向远处播散，从而发生异位种植。
2、体腔上皮化生学说：卵巢表面上皮、盆腔腹膜在持续受到性激素、经血或慢性炎症刺激时，可被激活转化为子宫内膜样组织。
3、诱导学说：未分化的腹膜组织在某些内源性生物化学诱导下可形成子宫内膜样组织。
另外，遗传因素、免疫与炎症因素等也可能与子宫内膜异位症的发生有关。
