但是，如果仅仅考虑精子的畸形率，不同的研究机构给出的标准不尽相同。一般来讲，正常精液中，如果畸形精子百分率高于50％则称为高畸形率精子，可以导致不育。畸形精子超过70％时，应进行染色体检查，如有染色体病，治疗则比较困难。
以下原因可以导致高畸形率精子症
1、泌尿生殖道感染（如前列腺炎、附睾结核、精囊炎、尿道炎等）；
2、腮腺炎并发的睾丸炎；
3、精索静脉曲张；
4、生活中不可避免使用激素或某些化学药物，这些均可使精子发育不成熟而导致畸形；
5、生殖腺受到放射线照射，可引起精子的突变；
6、阴囊局部长期高热、长期酗酒，均可使精子发生畸变等。
