对于女性来说，药物治疗适应于一部分病人，对于多囊卵巢综合征、无排卵性月经、卵泡不破裂及过早黄素化等可采用药物诱导排卵；对于黄体功能不全而反复流产或不孕者，可使用药物进行黄体期支持；对于月经不规律影响怀孕者，可调整月经、促排卵;对于促性腺激素水平增高的卵巢早衰患者，也可试用药物治疗。
除以上情况外，还有一些不孕症药物治疗是无效的，必须手术治疗。手术治疗适用于少量有器质性疾病者，如子宫肌瘤剔除、输卵管吻合、腹腔镜解除盆腔及输卵管粘连，这些情况下手术是必须的治疗方法。
在药物治疗和手术治疗无效的情况下，一些不孕患者需通过辅助生殖技术妊娠，包括常用的人工授精(由丈夫精液人工授精、供者精液人工授精等)、各种试管婴儿技术等。实施这些人类辅助生殖技术必须经过卫生部及省级卫生行政部门批准、获得批准证书方可实施。需要指出的是，辅助生殖技术治疗的妊娠率一般超不过正常夫妇的妊娠率，一个月经周期的辅助生殖技术妊娠的受孕率一般不会超过40％。
不孕不育症的治疗最重要的是需要夫妻双方的协同配合，要建立起耐心、信心和决心。生活中，夫妻中生育能力弱者，更容易焦虑甚或愧疚，所以在治疗期间夫妻双方应充分沟通，包容和体贴对方，不要一味的埋怨和厌烦。
